Історія Інституту післядипломної освіти починалася з грудня 2002 року. Сьогодні його діяльність охоплює такі напрями, як підвищення кваліфікації, заочна освіта та перепідготовка (друга вища освіта).

Діяльність ІПО обслуговують: бібліотека ЧДУ імені Петра Могили, комп’ютерні та інформаційні центри, 34 кафедри університету, де працюють більш ніж 388 викладачів, з яких 10 – заслужені діячі науки і техніки України, 8 – дійсні члени та члени-кореспонденти галузевих академій, 62 – доктори наук, 50 – професорів, 168 кандидатів наук, 124 – доценти, 69 – аспіранти, 4 - докторанти, 12 – іноземні викладачі, навчально-методичні працівники. На базі Інституту створений спеціалізований Центр соціально-психологічної підтримки, професійного розвитку та сприяння працевлаштуванню, який здійснює:  проведення тренінгів розвитку особистості, тренінгів формування професійних навичок;  використання альтернативних методик (“Форум-театр” та ін.);  проведення тренінгів із оформлення документів та методик при пошуці роботи для студентів випускних курсів. ІПО співпрацює з бібліотекою ЧДУ імені Петра Могили, комп’ютерними та інформаційними центрами, Миколаївським обласним центром зайнятості, Міжнародним фондом соціальної адаптації, Фондом соціального захисту інвалідів, ГО «Ліга офіцерів», ГО «Майстерня добра», Благодійною організацією «Конверсія військових кадрів» та іншими громадськими організаціями та приватними особами з надання послуг по підвищенню кваліфікації.